仙剑时空传既非前传，也非后传，游戏讲述的是一个痴迷仙友陈寒轩因机缘巧合进入仙剑游戏中，他不甘心灵儿悲惨命运的发生，为改变灵儿宿名而与游戏管理员作斗争的故事，其主线以仙剑游戏中一些经典剧情的经历来展现。

根据游戏隐藏任务的完成情况，有宿命未能改变的普通结局与改变灵儿宿命的隐藏结局两个结局。